| # | Rider | Team | Time | Gap |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Stefano Garzelli | Liquigas | 05:05:00 | |
| 2 | Giovanni Visconti | Team Milram | + 04 | + 04 |
| 3 | Santo Anzà | Selle Italia - Serramenti | + 08 | + 08 |
| 4 | Dainius Kairelis | Amore & Vita - McDonald's | + 11 | + 11 |
| 5 | Luca Mazzanti | Ceramica Panaria - Navigare | + 14 | + 14 |
| 6 | Massimiliano Maisto | CB Immobiliare - Universal | + 17 | + 17 |
| 7 | Benoît Salmon | Agritubel | + 17 | + 17 |
| 8 | Vincenzo Nibali | Liquigas | + 20 | + 20 |
| 9 | Rinaldo Nocentini | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 22 | + 22 |
| 10 | Tadej Valjavec | Lampre-Fondital | + 23 | + 23 |
| 11 | Félix Cárdenas | Barloworld | + 26 | + 26 |
| 12 | Ruslan Pidgornyy | Team Tenax Salmilano | + 29 | + 29 |
| 13 | Riccardo Riccò | Saunier Duval - Prodir | + 35 | + 35 |
| 14 | Paolo Bailetti | Team 3C Casalinghi Jet | + 51 | + 51 |
| 15 | Gilberto Simoni | Saunier Duval - Prodir | + 01:04 | + 01:04 |
| 16 | Marzio Bruseghin | Lampre-Fondital | + 01:04 | + 01:04 |
| 17 | Mauricio Soler | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 01:04 | + 01:04 |
| 18 | Massimiliano Gentili | Naturino - Sapore di Mare | + 01:04 | + 01:04 |
| 19 | Leonardo Moser | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 01:29 | + 01:29 |
| 20 | Kanstantsin Sivtsov | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 01:45 | + 01:45 |
| 21 | Franco Pellizotti | Liquigas | + 02:15 | + 02:15 |
| 22 | Leonardo Giordani | Naturino - Sapore di Mare | + 04:53 | + 04:53 |
| 23 | Domenico Pozzovivo | Ceramica Panaria - Navigare | + 04:53 | + 04:53 |
| 24 | Andrea Masciarelli | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 04:53 | + 04:53 |
| 25 | Tomasz Marczynski | Ceramica Flaminia | + 05:42 | + 05:42 |
| 26 | Mirko Celestino | Team Milram | + 06:04 | + 06:04 |
| 27 | Pedro Arreitunandia | Barloworld | + 07:41 | + 07:41 |
| 28 | Alessandro Bertolini | Selle Italia - Serramenti | + 09:35 | + 09:35 |
| 29 | Thomas Rohregger | Elk Haus - Simplon | + 09:35 | + 09:35 |
| 30 | Massimo Codol | Team Tenax Salmilano | + 09:35 | + 09:35 |
| 31 | Emanuele Bindi | OTC Doors - Lauretana | + 09:35 | + 09:35 |
| 32 | Przemyslaw Niemiec | Miche | + 09:35 | + 09:35 |
| 33 | Massimo Giunti | Naturino - Sapore di Mare | + 09:35 | + 09:35 |
| 34 | Marco Pinotti | Saunier Duval - Prodir | + 09:35 | + 09:35 |
| 35 | Oliver Zaugg | Saunier Duval - Prodir | + 09:35 | + 09:35 |
| 36 | Guido Trentin | Saunier Duval - Prodir | + 09:35 | + 09:35 |
| 37 | Stefano Cavallari | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 09:35 | + 09:35 |
| 38 | Sergio Barbero | Selle Italia - Serramenti | + 09:35 | + 09:35 |
| 39 | Fabio Gilioli | CB Immobiliare - Universal | + 09:35 | + 09:35 |
| 40 | Luca Solari | Team 3C Casalinghi Jet | + 09:35 | + 09:35 |
| 41 | Salvatore Commesso | Lampre-Fondital | + 09:35 | + 09:35 |
| 42 | Andriy Grivko | Team Milram | + 09:35 | + 09:35 |
| 43 | Hubert Krys | Ceramica Flaminia | + 09:35 | + 09:35 |
| 44 | Emanuele Sella | Ceramica Panaria - Navigare | + 09:35 | + 09:35 |
| 45 | Angel Rubiano Miguel | Ceramica Panaria - Navigare | + 09:35 | + 09:35 |
| 46 | Luis Laverde | Ceramica Panaria - Navigare | + 09:35 | + 09:35 |
| 47 | Damiano Cunego | Lampre-Fondital | + 09:35 | + 09:35 |
| 48 | Eros Capecchi | Liquigas | + 09:35 | + 09:35 |
| 49 | Amets Txurruka | Barloworld | + 09:35 | + 09:35 |
| 50 | Nicolas Fritsch | Saunier Duval - Prodir | + 09:35 | + 09:35 |
| 51 | Niklas Axelsson | Selle Italia - Serramenti | + 09:35 | + 09:35 |