| # | Rider | Team | Time | Gap |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Ivan Basso | Liquigas-Cannondale | 04:23:04 | |
| 2 | Fabio Duarte | Geox-TMC | + 00 | |
| 3 | Giovanni Visconti | Farnese Vini - Neri Sottoli | + 16 | + 16 |
| 4 | Jure Kocjan | Team Type 1 - Sanofi | + 16 | + 16 |
| 5 | Leonardo Duque | Cofidis | + 16 | + 16 |
| 6 | Fortunato Baliani | D'Angelo & Antenucci - Nippo | + 16 | + 16 |
| 7 | Rinaldo Nocentini | AG2R La Mondiale | + 16 | + 16 |
| 8 | Alexander Efimkin | Team Type 1 - Sanofi | + 16 | + 16 |
| 9 | Mauro Finetto | Liquigas-Cannondale | + 16 | + 16 |
| 10 | David Blanco | Geox-TMC | + 16 | + 16 |
| 11 | Mikaël Chérel | AG2R La Mondiale | + 16 | + 16 |
| 12 | Marco Marzano | Lampre-ISD | + 16 | + 16 |
| 13 | Maxime Bouet | AG2R La Mondiale | + 17 | + 17 |
| 14 | Tomasz Nose | Adria Mobil | + 17 | + 17 |
| 15 | Hubert Dupont | AG2R La Mondiale | + 17 | + 17 |
| 16 | Rémy Cusin | Cofidis | + 17 | + 17 |
| 17 | Nicolas Roche | AG2R La Mondiale | + 18 | + 18 |
| 18 | Rubens Bertogliati | Team Type 1 - Sanofi | + 18 | + 18 |
| 19 | Simon Spilak | Lampre-ISD | + 19 | + 19 |
| 20 | Matej Gnezda | Adria Mobil | + 01:05 | + 01:05 |
| 21 | Angel Mate Luis | Cofidis | + 01:06 | + 01:06 |
| 22 | Luca Ascani | D'Angelo & Antenucci - Nippo | + 01:06 | + 01:06 |
| 23 | Gianluca Brambilla | Colnago - CSF Inox | + 01:06 | + 01:06 |
| 24 | Reto Hollenstein | Team Vorarlberg | + 01:06 | + 01:06 |
| 25 | Elias Schmaeh | Price Your Bike | + 01:06 | + 01:06 |
| 26 | Emanuele Bindi | Meridiana - Kamen Team | + 01:06 | + 01:06 |
| 27 | Edoardo Girardi | De Rosa - Ceramica Flaminia | + 01:06 | + 01:06 |
| 28 | Javier Mejias | Team Type 1 - Sanofi | + 01:07 | + 01:07 |
| 29 | Mathieu Perget | AG2R La Mondiale | + 01:08 | + 01:08 |
| 30 | Patrik Sinkewitz | Farnese Vini - Neri Sottoli | + 01:08 | + 01:08 |
| 31 | Patxi Vila | De Rosa - Ceramica Flaminia | + 01:09 | + 01:09 |
| 32 | Cristiano Salerno | Liquigas-Cannondale | + 02:09 | + 02:09 |
| 33 | Ermanno Capelli | Team Vorarlberg | + 02:17 | + 02:17 |
| 34 | Paolo Bailetti | De Rosa - Ceramica Flaminia | + 02:17 | + 02:17 |
| 35 | Angelo Pagani | Colnago - CSF Inox | + 02:18 | + 02:18 |
| 36 | Andrea Pasqualon | Colnago - CSF Inox | + 02:18 | + 02:18 |
| 37 | Sergey Rudaskov | Itera - Katusha | + 03:00 | + 03:00 |
| 38 | Luca Barla | Androni Giocattoli - CIPI | + 03:01 | + 03:01 |
| 39 | Giampaolo Cheula | Geox-TMC | + 03:01 | + 03:01 |
| 40 | Daniele Ratto | Geox-TMC | + 03:39 | + 03:39 |
| 41 | Marco Corti | Geox-TMC | + 03:39 | + 03:39 |
| 42 | David Loosli | Lampre-ISD | + 03:39 | + 03:39 |
| 43 | Rein Taaramäe | Cofidis | + 05:15 | + 05:15 |
| 44 | Blaz Jarc | Adria Mobil | + 05:19 | + 05:19 |
| 45 | Alessandro Vanotti | Liquigas-Cannondale | + 07:12 | + 07:12 |
| 46 | Francesco Failli | Farnese Vini - Neri Sottoli | + 07:12 | + 07:12 |
| 47 | Giuseppe de Maria | De Rosa - Ceramica Flaminia | + 07:12 | + 07:12 |
| 48 | Remmert Wielinga | Itera - Katusha | + 07:12 | + 07:12 |
| 49 | Maciej Paterski | Liquigas-Cannondale | + 07:12 | + 07:12 |