| # | Rider | Team | Time | Gap |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Francesco Masciarelli | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | 05:12:08 | |
| 2 | Filippo Pozzato | Liquigas | + 04 | + 04 |
| 3 | Danilo Di Luca | LPR Brakes - Ballan | + 04 | + 04 |
| 4 | Matteo Tosatto | Quick Step | + 04 | + 04 |
| 5 | Christian Pfannberger | Barloworld | + 04 | + 04 |
| 6 | Damiano Cunego | Lampre | + 04 | + 04 |
| 7 | Roger Beuchat | Serramenti - Androni Giocattoli | + 04 | + 04 |
| 8 | Mauro Finetto | CSF Group - Navigare | + 04 | + 04 |
| 9 | Francesco Failli | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 04 | + 04 |
| 10 | Stefano Garzelli | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 04 | + 04 |
| 11 | Serguei Klimov | Tinkoff Credit Systems | + 04 | + 04 |
| 12 | Luigi Sestili | Ceramica Flaminia-Bossini Docce | + 04 | + 04 |
| 13 | Domenico Pozzovivo | CSF Group - Navigare | + 04 | + 04 |
| 14 | Giovanni Visconti | Quick Step | + 04 | + 04 |
| 15 | Giampaolo Caruso | Ceramica Flaminia-Bossini Docce | + 15 | + 15 |
| 16 | Andriy Grivko | Team Milram | + 15 | + 15 |
| 17 | Pavel Brutt | Tinkoff Credit Systems | + 15 | + 15 |
| 18 | Luca Solari | Serramenti - Androni Giocattoli | + 15 | + 15 |
| 19 | Mauricio Soler | Barloworld | + 15 | + 15 |
| 20 | Matej Jurco | Team Milram | + 15 | + 15 |
| 21 | Andrea Tonti | Quick Step | + 15 | + 15 |
| 22 | Danilo Hondo | Serramenti - Androni Giocattoli | + 15 | + 15 |
| 23 | Gorazd Stangelj | Liquigas | + 15 | + 15 |
| 24 | Valerio Agnoli | Liquigas | + 25 | + 25 |
| 25 | Marco Frapporti | CSF Group - Navigare | + 26 | + 26 |
| 26 | Andrea Noè | Liquigas | + 30 | + 30 |
| 27 | Michele Scarponi | Serramenti - Androni Giocattoli | + 58 | + 58 |
| 28 | Leonardo Giordani | Ceramica Flaminia-Bossini Docce | + 58 | + 58 |
| 29 | Andrea Masciarelli | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 58 | + 58 |
| 30 | Alessandro Ballan | Lampre | + 58 | + 58 |
| 31 | Sylwester Szmyd | Lampre | + 58 | + 58 |
| 32 | Federico Canuti | CSF Group - Navigare | + 58 | + 58 |
| 33 | Massimo Codol | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 58 | + 58 |
| 34 | Dario Atehortua Julilan | Ceramica Flaminia-Bossini Docce | + 58 | + 58 |
| 35 | Filippo Simeoni | Ceramica Flaminia-Bossini Docce | + 01:18 | + 01:18 |
| 36 | Niklas Axelsson | Serramenti - Androni Giocattoli | + 01:18 | + 01:18 |
| 37 | Vladimir Miholjevic | Liquigas | + 01:18 | + 01:18 |
| 38 | Fabio Taborre | Serramenti - Androni Giocattoli | + 01:18 | + 01:18 |
| 39 | Kjell Carlström | Liquigas | + 01:18 | + 01:18 |
| 40 | Paolo Tiralongo | Lampre | + 01:47 | + 01:47 |
| 41 | Aleksandr Kuschynski | Liquigas | + 01:47 | + 01:47 |
| 42 | Tomasz Marczynski | Ceramica Flaminia-Bossini Docce | + 01:47 | + 01:47 |
| 43 | Evgeni Petrov | Tinkoff Credit Systems | + 02:07 | + 02:07 |
| 44 | Vincenzo Nibali | Liquigas | + 02:07 | + 02:07 |
| 45 | Charles Wegelius | Liquigas | + 02:07 | + 02:07 |
| 46 | Fabio Sabatini | Team Milram | + 02:07 | + 02:07 |
| 47 | Riccardo Chiarini | LPR Brakes - Ballan | + 02:07 | + 02:07 |
| 48 | Dainius Kairelis | Ceramica Flaminia-Bossini Docce | + 02:07 | + 02:07 |
| 49 | Paolo Bailetti | LPR Brakes - Ballan | + 02:07 | + 02:07 |
| 50 | Marco Marzano | Lampre | + 02:07 | + 02:07 |
| 51 | Giairo Ermeti | LPR Brakes - Ballan | + 02:07 | + 02:07 |
| 52 | Simone Masciarelli | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 07:21 | + 07:21 |
| 53 | Luca Paolini | Acqua e Sapone - Caffe Mokambo | + 07:21 | + 07:21 |
| 54 | Enrico Gasparotto | Barloworld | + 07:21 | + 07:21 |
| 55 | Marco Corti | Barloworld | + 08:38 | + 08:38 |
| 56 | Daniele Pietropolli | LPR Brakes - Ballan | + 08:47 | + 08:47 |
| 57 | Gabriele Bosisio | LPR Brakes - Ballan | + 10:12 | + 10:12 |
| 58 | Santo Anzà | Serramenti - Androni Giocattoli | + 10:12 | + 10:12 |
| 59 | Alessandro Spezialetti | LPR Brakes - Ballan | + 10:12 | + 10:12 |
| 60 | Matej Mugerli | Liquigas | + 10:12 | + 10:12 |
| 61 | Mauro Santambrogio | Lampre | + 10:12 | + 10:12 |
| 62 | Marco Velo | Team Milram | + 10:12 | + 10:12 |
| 63 | Sergio Lagana | LPR Brakes - Ballan | + 10:12 | + 10:12 |
| 64 | Sergio Ghisalberti | Team Milram | + 10:12 | + 10:12 |
| 65 | Alexander Efimkin | Quick Step | + 10:12 | + 10:12 |