| # | Rider | Team | Time | Gap |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Gilberto Simoni | Lampre-Caffita | 05:13:50 | |
| 2 | Fränk Schleck | Team CSC | + 06 | + 06 |
| 3 | Mirko Celestino | Domina Vacanze | + 08 | + 08 |
| 4 | Davide Rebellin | Gerolsteiner | + 16 | + 16 |
| 5 | Alexander Arekeev | Acqua e Sapone - Adria Mobil | + 16 | + 16 |
| 6 | Carlos Sastre | Team CSC | + 22 | + 22 |
| 7 | Vladimir Miholjevic | Liquigas - Bianchi | + 40 | + 40 |
| 8 | Miguel Mercado Juan | Quick Step | + 49 | + 49 |
| 9 | Damiano Cunego | Lampre-Caffita | + 01:29 | + 01:29 |
| 10 | Luca Mazzanti | Ceramica Panaria - Navigare | + 01:34 | + 01:34 |
| 11 | Marco Marzano | Lampre-Caffita | + 02:25 | + 02:25 |
| 12 | Andrea Noè | Liquigas - Bianchi | + 02:25 | + 02:25 |
| 13 | Theo Eltink | Rabobank | + 02:39 | + 02:39 |
| 14 | Luca Solari | Domina Vacanze | + 02:54 | + 02:54 |
| 15 | Massimo Codol | Fassa Bortolo | + 03:04 | + 03:04 |
| 16 | Aitor Hernández | Team LPR | + 03:53 | + 03:53 |
| 17 | Ivan Fanelli | Team LPR | + 03:57 | + 03:57 |
| 18 | Gorazd Stangelj | Lampre-Caffita | + 03:57 | + 03:57 |
| 19 | Devis Miorin | Liquigas - Bianchi | + 03:59 | + 03:59 |
| 20 | Antonio Quadranti | Naturino - Sapore di Mare | + 04:03 | + 04:03 |
| 21 | Santo Anzà | Acqua e Sapone - Adria Mobil | + 04:23 | + 04:23 |
| 22 | Giovanni Visconti | Domina Vacanze | + 04:49 | + 04:49 |
| 23 | Kanstantsin Sivtsov | Fassa Bortolo | + 04:56 | + 04:56 |
| 24 | Pieter Weening | Rabobank | + 05:11 | + 05:11 |
| 25 | Nicki Sørensen | Team CSC | + 05:21 | + 05:21 |
| 26 | Valerio Agnoli | Naturino - Sapore di Mare | + 05:28 | + 05:28 |
| 27 | Philip Deignan | AG2R Prévoyance | + 07:02 | + 07:02 |
| 28 | Raffaele Ferrara | Team Androni Giocattoli - 3C Casali | + 09:37 | + 09:37 |
| 29 | Ivan Degasperi | Team LPR | + 09:37 | + 09:37 |